民國一零三年八月組織再造成立二個新組，分別為「學術發展組」及「校務資料組」，並同時改「建教合作組」為「計畫管考組」。民國一零九年四月進行組織功能與人力盤點，凝聚共識及自我定位以：「全校基礎研發成績躍升及改善學校軟硬體研究環境」為任務目標，進行組織縮編。原企劃組擔任之校務資源配置角色之功能已漸式微，爰縮編企劃組。國立成大研究發展處修訂其組織架構，原本處下設之儀器設備中心併入核心設施中心。本處組織架構調整後，共下設三組「校務資料組」、「計畫管考組」及「學術發展組」。